Además de la inclusión por parte del propio paciente, el Registro de Pacientes de Enfermedades Raras (RePER) también permite la inclusión de información por parte de profesionales, ya sean investigadores o sociedades médicas.

Se puede colaborar con el RePER de dos formas: Mediante la inclusión de un registro ya existente, o mediante el desarrollo de un nuevo registro. La incorporación al RePER supone una reducción de costes, mayor promoción así como una menor fragmentación en el número de casos.

En cualquier caso, la inclusión de un registro nuevo, o ya existente, en el RePER permite mantener la identidad o autonomía de cada registro.