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Investigación

Unidad de Genómica Funcional (Tumores Sólidos Infantiles)

Líneas de investigación

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Unidad de Genómica Funcional (Tumores Sólidos Infantiles)

El objetivo principal de nuestro grupo es la identificación de las bases moleculares de los tumores infantiles y otras enfermedades raras de origen genético. Para ello empleamos modelos celulares y animales de la enfermedad, tecnologías de análisis genómico de alto rendimiento para identificar los genes implicados en el desarrollo de estas patologías y otros tipos de estudios (basados en tecnologías shRNA y librerías CRISPR) para caracterizar funcionalmente los genes identificados. El objetivo final es identificar genes diana que permitan el desarrollo y diseño de terapias dirigidas más eficaces y con menos efectos secundarios.

Personalizado

Publicaciones destacadas

Categoría

DNA Methylomes Reveal Biological Networks Involved in Human Eye Development, Functions and Associated Disorders. Sci Rep. (2017) 7(1):11762.

Berdasco M, Gómez A, Rubio MJ, Català-Mora J, Zanón-Moreno V, Lopez M, Hernández C, Yoshida S, Nakama T, Ishikawa K, Ishibashi T, Boubekeur AM, Louhibi L, Pujana MA, Sayols S, Setien F, Corella D, de Torres C, Parareda A, Mora J, Zhao L, Zhang K, Lleonart ME, Alonso J, Simó R, Caminal JM, Esteller M.

PUBMED DOI

Lysyl oxidase is downregulated by the EWS/FLI1 oncoprotein and its propeptide domain displays tumor supressor activities in ewing sarcoma cells. PLoS One (2013) 10.1371/journal.pone.0066281

Agra N., Cidre F., García-García L., de la Parra J., Alonso J.

PUBMED DOI

Periostin: A matricellular protein with multiple functions in cancer development and progression. Front. Oncol. (2018) 8:225

González-González L., Alonso J.

PUBMED DOI

EWS-FLI1-mediated suppression of the RAS-antagonist Sprouty 1 (SPRY1) confers aggressiveness to Ewing sarcoma. Oncogene (2017) 36(6):766-776.

Cidre-Aranaz F, Grünewald TG, Surdez D, García-García L, Carlos Lázaro J, Kirchner T, González-González L, Sastre A, García-Miguel P, López-Pérez SE, Monzón S, Delattre O, Alonso J.

PUBMED DOI

DICER1 mutation and tumors associated with a famílial tumor predisposition syndrome: practical considerations. Familial Cancer (2017) 16:291-294

Bardón-Cancho E.J., Haro-Díaz A., Alonso-García de la Rosa J., Huerta-Aragonés J., García-Morín M., González-Martínez F., Garrido-Colino C.

PUBMED DOI

Familial retinoblastoma due to intronic LINE-1 insertion causes aberrant and non-canonical mRNA splicing of the RB1 gene. J Hum Genet (2016) 61(5):463-6.

Rodríguez-Martín C., Cidre-Aranaz F., Fernández-Teijeiro A., Gómez-Mariano G., de la Vega L., Ramos P., Zaballos A., Monzón S., Alonso J.

PUBMED DOI

SpainUDP: The Spanish Undiagnosed Rare Diseases Program. Int J Environ Res Public Health. (2018) 15(8). pii: E1746.

López-Martín E, Martínez-Delgado B, Bermejo-Sánchez E, Alonso J, SpainUDP Network, Posada M.

PUBMED DOI

Chimeric EWSR1-FLI1 regulates the Ewing sarcoma susceptibility gene EGR2 via a GGAA-microsatellite. Nature Genetics (2015) 47(9):1073-8.

Grünewald T.G.P., Bernard V., Gilardi-Hebenstreit P., Raynal V., Surdez D., Aynaud M.M., Mirabeau O., Cidre-Aranaz F., Tirode F., Zaidi S., Perot G., Jonker A.H., Lucchesi C., Le Deley M.C., Oberlin O., Marec-Bérard P., Véron A.S., Reynaud S., Lapouble E., Boeva V., Frio T.R, Alonso J., Bhatia S., Pierron G., Cancel-Tassin G., Cussenot O., Cox D.G., Morton L.M., Machiela M., Chanock S.J., Charnay P., Delattre O.

PUBMED DOI

Identification of genetic variants in pharmacokinetic genes associated with Ewing Sarcoma treatment outcome. Ann Oncol (2016) 27(9):1788-93.

Ruiz-Pinto S, Pita G, Patiño-García A, García-Miguel P, Alonso J, Pérez-Martínez A, Sastre A, Gómez-Mariano G, Lissat A, Scotlandi K, Serra M, Ladenstein R, Lapouble E, Pierron G, Kontny U, Picci P, Kovar H, Delattre O, González-Neira A.

PUBMED DOI

EWS/FLI1 target genes and therapeutic opportunities in Ewing sarcoma. Front. Oncol. (2015)

Cidre-Aranaz F., Alonso J.

PUBMED DOI

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Listado de personal

Información adicional

Bases moleculares del sarcoma de Ewing. Identificación de nuevas dianas terapéuticas. El sarcoma de Ewing es un tumor pediátrico muy agresivo que se caracteriza desde el punto de vista genético por la presencia de traslocaciones cromosómicas que dan lugar a factores de transcripción aberrantes formados por la fusión de dos genes (principalmente EWSR1 y FLI1). Estos factores de transcripción quiméricos (p. ej. EWSR1-FLI1) inducen e inhiben la expresión de genes que son claves en el proceso tumorogénico. Uno de nuestros principales objetivos es la caracterización funcional de los genes diana de EWSR1-FLI1 que están implicados en el desarrollo del tumor con el objeto de identificar nuevas dianas terapéuticas. Caracterización genética de tumores infantiles. Programa de medicina de precisión en cáncer infantil El objetivo de este proyecto es evaluar la utilidad de la secuenciación masiva para caracterizar las alteraciones genéticas tumorales presentes en pacientes con cáncer infantil y valorar, en el contexto de un equipo multidisciplinar, la utilidad diagnóstica, pronóstica y terapéutica de las alteraciones identificadas. Este proyecto está abierto a colaboraciones con los servicios de oncología pediátrica interesados en el mismo Programa de pacientes sin diagnóstico SpainUDP Nuestro grupo también participa en el programa de pacientes sin diagnóstico (SpainUDP) del IIER, contribuyendo a caracterizar las bases moleculares de los casos más complejos mediante el diseño y realización de estudios funcionales ad hoc.
  1. Bases moleculares del sarcoma de Ewing. Identificación de nuevas dianas terapéuticas. El sarcoma de Ewing es un tumor pediátrico muy agresivo que se caracteriza desde el punto de vista genético por la presencia de traslocaciones cromosómicas que dan lugar a factores de transcripción aberrantes formados por la fusión de dos genes (principalmente EWSR1 y FLI1). Estos factores de transcripción quiméricos (p. ej. EWSR1-FLI1) inducen e inhiben la expresión de genes que son claves en el proceso tumorogénico. Uno de nuestros principales objetivos es la caracterización funcional de los genes diana de EWSR1-FLI1 que están implicados en el desarrollo del tumor con el objeto de identificar nuevas dianas terapéuticas.
  2. Caracterización genética de tumores infantiles. Programa de medicina de precisión en cáncer infantil El objetivo de este proyecto es evaluar la utilidad de la secuenciación masiva para caracterizar las alteraciones genéticas tumorales presentes en pacientes con cáncer infantil y valorar, en el contexto de un equipo multidisciplinar, la utilidad diagnóstica, pronóstica y terapéutica de las alteraciones identificadas.  Este proyecto está abierto a colaboraciones con los servicios de oncología pediátrica interesados en el mismo
  3. Programa de pacientes sin diagnóstico SpainUDP Nuestro grupo también participa en el programa de pacientes sin diagnóstico (SpainUDP) del IIER, contribuyendo a caracterizar las bases moleculares de los casos más complejos mediante el diseño y realización de estudios funcionales ad hoc.

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