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Genética Molecular

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Content with Investigacion Unidad de Genómica Funcional (Tumores Sólidos Infantiles) .

Identificación y caracterización funcional de genes diana de la oncoproteína EWSR1::FLI1 característica de los sarcomas de Ewing

Los sarcomas de Ewing son un tipo de tumores de la infancia y la adolescencia que se caracterizan por la presencia de translocaciones cromosómicas que dan lugar a factores de transcripción quiméricos. La más frecuente de estas alteraciones cromosómicas fusiona el gen EWSR1 con el gen FLI1, dando lugar al factor de transcripción aberrante EWSR1::FLI1. EWSR1::FLI1 desempeña un papel fundamental en el desarrollo del sarcoma de Ewing, ya que regula la expresión de centenares de genes implicados en el proceso tumoral. En nuestro laboratorio combinamos el uso de tecnologías shRNA y CRISPR/Cas9 para generar modelos de enfermedad con las técnicas más avanzadas de análisis genómico y proteómico para identificar los genes implicados en el desarrollo del sarcoma de Ewing. El objetivo final es identificar genes diana que permitan el desarrollo y diseño de terapias dirigidas más eficaces y con menos efectos secundarios.

Desarrollo de terapias avanzadas para el tratamiento del sarcoma de Ewing

El tratamiento estandar del sarcoma de Ewing se basa en el uso de quimioterapia, radioterapia y cirugía. Aunque estos tratamientos son relativamente eficaces para algunos tumores localizados, son totalmente ineficientes en el caso de pacientes con tumores metastásicos o resistentes a los tratamientos convencionales. Como consecuencia de la falta de alternativas terapéuticas eficaces, tres de cada cuatro niños o adolescentes con tumores metastásicos o refractarios morirán por causa de la enfermedad. Es por tanto urgente desarrollar nuevas terapias para dar respuesta a este grupo de pacientes. En nuestro laboratorio estamos trabajando en el desarrollo de terapias disruptivas, que representen un enfoque totalmente novedoso para el tratamiento de esta enfermedad. Nuestra apuesta se basa en el uso de aproximaciones de terapia génica y el uso de vectores virales (principalmente adenovirus) y no virales (principalmente nanopartículas lipídicas) para vehiculizar las terapias a las células tumorales.

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Liver organoids reproduce alpha-1 antitrypsin deficiency-related liver disease

Gómez-Mariano G, Matamala N, Martínez S, Justo I, Marcacuzco A, Jimenez C, Monzón S, Cuesta I, Garfia C, Martínez MT, Huch M, Pérez de Castro I, Posada M, Janciauskiene S, Martínez-Delgado B. Liver organoids reproduce alpha-1 antitrypsin deficiency-related liver disease. Hepatol Int. 2020 Jan;14(1):127-137.

PUBMED DOI

The Solve-RD Solvathons as a pan-European interdisciplinary collaboration to diagnose patients with rare disease.

Yépez VA, Demidov G, Ellwanger K, Laurie S, Luknárová R, Joseph Maran MI, Hentrich T, Sagath L, van der Sanden B, Astuti G, Neveling K, Batlle-Masó L, Beijer D, Brechtmann F, Caballero-Oteyza A, Dabad M, Denommé-Pichon AS, Doornbos C, Eddafir Z, Estévez-Arias B, Kilicarslan OA, Kolen IHM, Kraß L, Lohmann K, Londhe S, López-Martín E, Maassen K, Macken W, Martínez-Delgado B, Mei D, Mertes C, Minardi R, Morsy H, Mueller JS, Natera-de Benito D, Nelson I, Oud MM, Paramonov I, Picó D, Piscia D, Polavarapu K, Raineri E, Savarese M, Smal N, Steehouwer M, Steyaert W, Swertz MA, Thomsen M, Töpf A, Van de Vondel L, van der Vries G, Vitobello A, Wilke C, Zurek B; Solve-RD DITF-EPICARE; Solve-RD DITF-ITHACA; Solve-RD DITF-EURO-NMD; Solve-RD DITF-RITA; Solve-RD DITF-RND; Solve-RD consortium; T' Hoen PB, Matalonga L, Vissers LELM, Gilissen C, Schulze-Hentrich J, Beltran S, Esteve-Codina A, Hoischen A, Gagneur J, Graessner H. Nat Genet. 2025 Sep 9. doi: 10.1038/s41588-025-02290-3. Online ahead of print. PMID: 40926087 Review.

PUBMED DOI

Heterozygous Missense Variants in the ATPase Phospholipid Transporting 9A Gene, ATP9A, Alter Dendritic Spine Maturation and Cause Dominantly Inherited Nonsyndromic Intellectual Disability.

Cordovado A, Hérenger Y, Cormier C, López-Martín E, Stamberger H, Faivre L, Denommé-Pichon AS, Vitobello A, Abdallah HH, Barcia G, Courtin T, Martínez-Delgado B, Bermejo-Sánchez E, Barrero MJ, Gasser B, Bezieau S, Küry S, Weckhuysen S, Laumonnier F, Toutain A, Vuillaume ML. Hum Mutat. 2025 Mar 5;2025:7085599. doi: 10.1155/humu/7085599. eCollection 2025. PMID: 40226306 Free PMC article.

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Adult neurogenesis through glial transdifferentiation in a CNS injury paradigm

Casas-Tinto S, Garcia-Guillen N, Losada-Perez M. Adult neurogenesis through glial transdifferentiation in a CNS injury paradigm. Elife. 2025 Mar 7;13:RP96890. doi: 10.7554/eLife.96890. PMID: 40052673; PMCID: PMC11888597.

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Drosophila melanogaster as a Model System for Human Glioblastoma

de Los Reyes Corrales T, Casas-Tintó S. Drosophila melanogaster as a Model System for Human Glioblastoma. Adv Exp Med Biol. 2025;1482:209-227. doi: 10.1007/978-3-031-97035-1_11. PMID: 40745143.

PUBMED DOI

VP3.15, a dual GSK-3β/PDE7 inhibitor, reduces glioblastoma tumor growth though changes in the tumor microenvironment in a PTEN wild-type context

Castello-Pons M, Ramirez-Gonzalez MA, Iglesias-Hernández P, Lendo NL, Rodriguez-Martín C, Quiralte L, Sepúlveda-Sánchez JM, de Dios O, Gil C, Martínez A, Sánchez-Gómez P, Casas-Tinto S. VP3.15, a dual GSK-3β/PDE7 inhibitor, reduces glioblastoma tumor growth though changes in the tumor microenvironment in a PTEN wild-type context. Neurotherapeutics. 2025 Jul;22(4):e00576. doi: 10.1016/j.neurot.2025.e00576. Epub 2025 Mar 28. PMID: 40157890; PMCID: PMC12418426.

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Drosophila as a Model for Human Disease: Insights into Rare and Ultra-Rare Diseases.

Casas-Tintó S. Drosophila as a Model for Human Disease: Insights into Rare and Ultra-Rare Diseases. Insects. 2024 Nov 6;15(11):870. doi: 10.3390/insects15110870. PMID: 39590469; PMCID: PMC11594678.

PUBMED DOI

Three Decades of the Spanish Society for Developmental Biology (SEBD): Insights and Emerging Perspectives from the 18th Spanish Society for Developmental Biology Meeting (SEBD 2024)

Herrera E, Acosta S, Almuedo M, Borrell V, Cañestro C, Casas-Tintó S, Escudero LM, Gorfinkiel N, Hoijman E, Pastor-Pareja JC, Pernaute B, Rayón T, Saade M, Solana J, Trivedi V, Martí E, Pujades C, Araújo SJ. Three Decades of the Spanish Society for Developmental Biology (SEBD): Insights and Emerging Perspectives from the 18th Spanish Society for Developmental Biology Meeting (SEBD 2024). Int J Dev Biol. 2025;69(1):1-9. doi: 10.1387/ijdb.250034sa. PMID: 40298871.

PUBMED DOI

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Información adicional

Nuestro grupo está centrado en la investigación del Déficit de Alfa-1 antitripsina (DAAT). Estudiamos esta enfermedad desde diferentes puntos de vista: desde el diagnóstico genético, regulación génica, mecanismos moleculares y fisiopatología de la enfermedad hasta la investigación de nuevas terapias. Parte del interés se centra en la identificación de variantes comunes y raras en el gen causante de la enfermedad, SERPINA1, y otros genes relacionados.

Además de las variantes más frecuentes (S y Z) y otras variantes raras ya conocidas (Malton, Mattawa, Procida, Lowel, Herleen, I, F ), nuestro grupo ha contribuido a la descripción y caracterización de más de diez nuevas variantes causantes de la enfermedad, incluyendo un nuevo alelo nulo (QOmadrid). Por otro lado tenemos un gran interés en investigar los mecanismos que regulan la transcripción del gen SERPINA1, así como la caracterización de transcritos alternativos y sus variaciones específicas de tejido y la regulación de la expresión génica mediada por miRNAs. Además hemos desarrollado un modelo celular en 3D de la enfermedad hepática asociada al DAAT, basado en la formación de organoides de hígado.

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Resultados de investigación